Im Rahmen des Fortsetzungsantrages werden die Methoden und Ergebnisse aus der ersten Förderphase konsequent weiterentwickelt. Die DNA- sequenzbasierte Typisierung wird zielgerichtet hin zu einer validen und auch kommerziell nutzbaren Methodik verfeinert. Die Etablierung der SNP- Typisierung wird gezielt auf den definierten Sequenztyp Complex 29 ausgerichtet. Weiterhin sollen STEC-Kolonisierungsfaktoren identifiziert werden, die von „Super-Shedder“ Rinder exprimiert werden, die andere STEC-Serotypen ausscheiden als O157:H7. Die Unterschiede im Genexpressionsmuster zwischen humanen und tierischen Spezies als Antwort auf verschiedene Salmonella Serovare sollen ermittelt werden. Daten aus den humanen und Hühner-Mikroarray-Studien aus der ersten Förderperiode werden benutzt, um gemeinsame und unterschiedliche Antworten an Rezeptoren / Signalwegen zu identifizieren, die zu einer Wirtsadaption in für die Lebensmitten wichtigen Tierarten führen.

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